mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GAAAGTGCTTTCTGTTTTGGGCG CCCAAAACGGGGCTCTCTCTT AGCACCCAAAACGGGGCTCTCTCTTGTGTATGAATTATGGTGAGAAAGTGCTTTCTGTTTTGGGCGTTGT 3 2 3' arm Xenopus_tropicalis mirbase 100 xtr-mir-427-2 3e-34 -24.8 (((.(((((((((((((.((.(((..((((.....))).)..))).)).)))..)))))))))).))).. (-24.80)