mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGGTAGTAGTTTGTGCTGT TGCGCAAGCTACTGCCTTGCT CTGGCTGAGGTAGTAGTTTGTGCTGTTGGTCGGGTTGTGACATTGCCCGCTGTGGAGATAACTGCGCAAGCTACTGCCTTGCTA 2 0 5' arm Gallus_gallus mirbase let-7 2e-29 tgu-let-7i 2e-42 -39.6 .((((.(((((((((((((((((.(((((.(((((.........)))))))........))).))))))))))))))))))))) (-39.60)