mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAATGTAAAGAAGTATGTA CATACTTCTTTATGTACCCATA ACCTGCTCAGAGCACATACTTCTTTATGTACCCATATGAACATACAATGCTATGGAATGTAAAGAAGTATGTATTTTTGGCAGGC 2 1 3' arm Gallus_gallus mirbase mir-1 6e-30 hsa-mir-1-2 6e-36 -33.24 .((((((.((((.((((((((((((((((..(((((..............))))).)))))))))))))))).)))).)))))). (-33.24)