mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCAGCACGTAAATATTGGTG CCAATATTATTGTGCTGCTTAA CCTACTTGTTCCGCCCTAGCAGCACGTAAATATTGGTGTAGTAAAATAAACCTTAAACCCCAATATTATTGTGCTGCTTAAGCGTGGCAGAGAT 4 0 5' arm Gallus_gallus mirbase mir-16 2e-39 bta-mir-16b 9e-26 -32.8 .....((((..(((...(((((((((..((((((((.((..(((........))).)).))))))))..)))))))))...)))..)))).... (-32.80)