mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAAGTGCTTATAGTGCAGGTAG AATCTACTGCATTATAAGCACTTAAAGT TGACAGCTCTTGTAGCACTAAAGTGCTTATAGTGCAGGTAGTGTTCACTAATCTACTGCATTATAAGCACTTAAAGTACTGCTAGCTGTAGAACTACA 2 5 5' arm Gallus_gallus mirbase mir-17 2e-39 tgu-mir-20a 7e-36 -42.5 ..((((((...((((.(((.(((((((((((((((((.((((....)))).....)))))))))))))))))..))).)))).))))))......... (-42.50)