mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCACAGTGGCTAAGTTCTGC AGAGCTTAGCTGATTGGTGAACA ACCTCTCTGGTGAGGTGCAGAGCTTAGCTGATTGGTGAACAGTGATTGTTTCCCTCTTTGTTCACAGTGGCTAAGTTCTGCACCTGAAGAGAAGGTG 2 2 3' arm Gallus_gallus mirbase mir-27 4e-28 tgu-mir-27 1e-40 -50.3 ((((((((....((((((((((((((((((....((((((((.((.........)).))))))))..))))))))))))))))))..)))).)))). (-50.30)