mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATGCTGCATCGGCAATAAG GTTTGCGGGTGTGGCATCATC AGATCTCTGTAGAGGGAAGCACAGTCACTGTTTGCGGGTGTGGCATCATCAAGATTCACAAAACTTTGAAAGGGGGTGTTGAGTGGCAGTGCATGAGATGAGGTGGTTGTGGATGGTGGCCCCTCACAGTACCCCCTCGAGATGGGAATCTTGATGATGCTGCATCGGCAATAAGTGACTACTTTTTTAAGCTGCAAACCA GGATTAGTCTTAATTTTTTAGTGTTGTTTTCTCAAAGCAAAAGGTTCTTCTCCCAAGTGGGTCTTTTACAATGATTCTAAAGATGGGTTTCTGTAGCTTTCTCATCACATTCTTTTCTTCTCAATCTACACTTTGGCTACAGAGTTCAGGGTTTGCTTTAGGTTAAAGGATTATCTGCTTTTCTTTCCCCTTTCATCTTTTTTGAATTTTTTGGTGTTTTTGTGCATGGGGGGATGATTGATGAAGATCTCTGTAGAGGGAAGCACAGTCACTGTTTGCGGGTGTGGCATCATCAAGATTCACAAAACTTTGAAAGGGGGTGTTGAGTGGCAGTGCATGAGATGAGGTGGTTGTGGATGGTGGCCCCTCACAGTACCCCCTCGAGATGGGAATCTTGATGATGCTGCATCGGCAATAAGTGACTACTTTTTTAAGCTGCAAACCAAGGCATGCAACAGAAAGAGATTAAGAAGAGGAGAGAGCGCATACATTAAGGAAATTGGAACTGCTAATTAAGCGTGATTTGTCGTGAAGATAGATGTTCGTCCTGGTGCCTGTTACACGACATGGTTATAGCCCCATATTAAACTGTATTCGAGCCGCACCAGGGGTTATATATAACTCTGCTGTAGAGGTTGATTTGTCGTGAAGGGGAGTATTACCCTTTCTTTGAAGCTCTTATATTAAGGAGAACAGAAAAATAGTTCACTTATGTAGTAAGAAGATTCATAAACTCTAATCAACAGTTTATGCCCTTTTTTGATATGCTTTTTATTT 3 0 3' arm Saruma_henryi mirnest mir-172 0.000000003 ptc-MIR172e 0.0000000002 -75.3 .......(((((..(((((...(((((((..((((.(((((((((((((((((((((.((....(((((..(((((((.((((.(((.((.(((((..........))))).))....))).))))...)))))))))))).)).))))))))))))))))))))).))))..)))))))...)))))...)))))..... (-75.3)