mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGAATCTTGATGATGCTGCAT GTGGCATCATCAAGATTCACA AGATCTCTGTAGAGGGAAGCACAGTCACTGTTTGCGGGTGTGGCATCATCAAGATTCACAAAACTTTGAAAGGGGGTGTTGAGTGGCAGTGCATGAGATGAGGTGGTTGTGGATGGTGGCCCCTCACAGTACCCCCTCGAGATGGGAATCTTGATGATGCTGCATCGGCAATAAGTGACTACTTTTTTAAGCTGCAAACCA GGATTAGTCTTAATTTTTTAGTGTTGTTTTCTCAAAGCAAAAGGTTCTTCTCCCAAGTGGGTCTTTTACAATGATTCTAAAGATGGGTTTCTGTAGCTTTCTCATCACATTCTTTTCTTCTCAATCTACACTTTGGCTACAGAGTTCAGGGTTTGCTTTAGGTTAAAGGATTATCTGCTTTTCTTTCCCCTTTCATCTTTTTTGAATTTTTTGGTGTTTTTGTGCATGGGGGGATGATTGATGAAGATCTCTGTAGAGGGAAGCACAGTCACTGTTTGCGGGTGTGGCATCATCAAGATTCACAAAACTTTGAAAGGGGGTGTTGAGTGGCAGTGCATGAGATGAGGTGGTTGTGGATGGTGGCCCCTCACAGTACCCCCTCGAGATGGGAATCTTGATGATGCTGCATCGGCAATAAGTGACTACTTTTTTAAGCTGCAAACCAAGGCATGCAACAGAAAGAGATTAAGAAGAGGAGAGAGCGCATACATTAAGGAAATTGGAACTGCTAATTAAGCGTGATTTGTCGTGAAGATAGATGTTCGTCCTGGTGCCTGTTACACGACATGGTTATAGCCCCATATTAAACTGTATTCGAGCCGCACCAGGGGTTATATATAACTCTGCTGTAGAGGTTGATTTGTCGTGAAGGGGAGTATTACCCTTTCTTTGAAGCTCTTATATTAAGGAGAACAGAAAAATAGTTCACTTATGTAGTAAGAAGATTCATAAACTCTAATCAACAGTTTATGCCCTTTTTTGATATGCTTTTTATTT 1 0 3' arm Saruma_henryi mirnest mir-172 3.0E-9 ptc-MIR172e 2.0E-10 -75.3 .......(((((..(((((...(((((((..((((.(((((((((((((((((((((.((....(((((..(((((((.((((.(((.((.(((((..........))))).))....))).))))...)))))))))))).)).))))))))))))))))))))).))))..)))))))...)))))...)))))..... (-75.3)