mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTACAGTACTGTGATAACTGAA GCTCAGTTATCACAGTGCTGATGCTG GCTGCCCTGGCTCAGTTATCACAGTGCTGATGCTGTCTCTTGTAAAGGTACAGTACTGTGATAACTGAAGGATGGC 0 4 3' arm Gallus_gallus mirbase mir-101 2e-35 tgu-mir-101-2 1e-33 -37.8 (((..(((...((((((((((((((((((.((((..(....)....)))))))))))))))))))))))))..))) (-37.80)