mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTAAGGCACGCAGTGAATGCCA GTGTTCACTGCAGACCTTGATT AGCCCCAGCGTTTTGTGTTCACTGCAGACCTTGATTTAATGTCACACGATTAAGGCACGCAGTGAATGCCAAAGTTTGGGGCAGCCTGGGCTG 4 0 3' arm Gallus_gallus mirbase mir-124 8e-39 xtr-mir-124 0.000000000000005 -39.4 .(((((((..(((.(((((((((((...((((((((...........))))))))...))))))))))).)))..))))))).((....)).. (-39.40)