mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGTCCCCTTCAACCAGCTGT AGCTGGTAAAATGGAACCAAAT GTGAGGCCAAATGCTTTGCTAAAGCTGGTAAAATGGAACCAAATCAACTGTTCAATGGATTTGGTCCCCTTCAACCAGCTGTAGCTGTGCATTGAT 5 0 3' arm Gallus_gallus mirbase mir-133 8e-36 cfa-mir-133c 1e-43 -35 .........(((((...((((.(((((((..((.((.((((((((............)))))))).)).))..))))))).))))...)))))... (-35.00)