mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGTCCCCTTCAACCAGCTA GCTGGTCAAACGGAACCAAGC CTCTGCTCTGGCTGGTCAAACGGAACCAAGCCCGTCTTCTTCGGAGGTTTGGTCCCCTTCAACCAGCTATAGCAGTGTTGAAAA 4 0 3' arm Gallus_gallus mirbase mir-133 3e-41 tgu-mir-133-2 2e-32 -37.2 (.(((((.((((((((..((.((.((((((((.....((....)))))))))).)).))..)))))))).))))).)....... (-37.20)