mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGGCTTTTTATTCCTATGTGA ATGTAGGGATGGAAGCCATGAA AGATAAATTCACTCTAGTGTTTTATGGCTTTTTATTCCTATGTGATAGTAATAAAGTCTCATGTAGGGATGGAAGCCATGAAATACATTGTGAAAAATCA 0 1 5' arm Gallus_gallus mirbase mir-135 9e-45 oan-mir-135a 5e-52 -39.1 .(((...(((((....((((((((((((((((.((((((((((((.(.(.....).).))))))))))))))))))))))))))))...)))))..))). (-39.10)