mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGGCTTTTTATTCCTATGTGA ATGTAGGGCGAAAAGCCATGGG CCCTCTGCTGTGGTCTATGGCTTTTTATTCCTATGTGATTGCTTTTCCTAACTCATGTAGGGCGAAAAGCCATGGGCTACTCAGGGGAGGGACTCC 1 1 5' arm Gallus_gallus mirbase mir-135 9e-45 tgu-mir-135a-2 3e-32 -47.5 ((((((.(((((((((((((((((((..(((((((((((((.......))).)))))))))).)))))))))))))))))..)).))))))..... (-47.50)