mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGAACTGAATTCCATGGGTT CCCATGGGGCTCAGTTCTTCAG GTGTATCCTCAGCTTTGAGAACTGAATTCCATGGGTTGTAATTGAATCCTTTGTCAGACCCATGGGGCTCAGTTCTTCAGCTTGGATATTTCTGTCTTC 2 0 5' arm Gallus_gallus mirbase mir-146 4e-47 tgu-mir-146c 6e-27 -39.4 ..((((((..((((..(((((((((.(((((((((((.....(((........)))))))))))))).))))))))).)))).)))))).......... (-39.40)