mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGAACTGAATTCCATGGACTG GTCCATGGTATTCAGTTCTCTAG GAAGATGTGACGAATCTTGGCAGTTCCCAGCTCTGAGAACTGAATTCCATGGACTGGTTTCAATTCCATGCGTTCAGTCCATGGTATTCAGTTCTCTAGCTTGGCTGCATCAAACTTCACAACTGCTAA 2 0 5' arm Gallus_gallus mirbase mir-146 8e-49 gga-mir-146c-1 3e-69 -54.33 ..((.(((((.........((((..((.((((..(((((((((((.(((((((((((...((......))...))))))))))).))))))))))).)))).))))))........))))).))..... (-54.33)