mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGCATAGTCACAAAAGTGA ATTTTTGTGATGTTGCAGCT AGCGGTTGCCAGTGTCATTTTTGTGATGTTGCAGCTAGTAATATGAGCCCAGTTGCATAGTCACAAAAGTGATCATTGGAAACTGTG 2 0 3' arm Gallus_gallus mirbase mir-153 4e-40 mdo-mir-153-2 6e-42 -40.8 .((((((.(((((((((((((((((((..(((((((.((.......))..)))))))..))))))))))))).)))))).)))))). (-40.80)