mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AACATTCAACGCTGTCGGTGAGT CATCGACCGTTGATTGTACC TGTAGTGGTTGCTTCAGTGAACATTCAACGCTGTCGGTGAGTTTGGAATTTAAGTGAAAACCATCGACCGTTGATTGTACCCTCCAGCTAACCATCCTCCTCCT 2 3 5' arm Gallus_gallus mirbase mir-181 5e-34 tgu-mir-181a-1 2e-33 -32 ....(((((((((..((.(.(((.((((((..(((((((.((((...((....))..))))))))))))))))).))).).))..))).))))))......... (-32.00)