mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGGTAGTTTCATGTTGTTGG TACAGCACGAAACTGCCTTAA AACTGCTCTGTGGTTTAGGTAGTTTCATGTTGTTGGGGCTCCACCTTTCTCTCTACAGCACGAAACTGCCTTAATTACTTCAGTTGATATCATC 3 0 5' arm Gallus_gallus mirbase mir-196 1e-43 mdo-mir-196b 2e-29 -32.8 (((((....((((((.((((((((((.((((((.((((...........)))).)))))).)))))))))).))))))..)))))......... (-32.80)