mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCCAGTGTTCAGACTACCTGTTC ACAGTAGTCTGCACATTGGTTA CTCCACTCCGTCTGCCCAGTGTTCAGACTACCTGTTCAGGACTACGAGATTGTACAGTAGTCTGCACATTGGTTAGGCTGTGCTGGGATACACC 3 1 5' arm Gallus_gallus mirbase mir-199 3e-47 tgu-mir-199-1 1e-34 -35.2 .(((((.(.(((((.(((((((.((((((((.(((.(((..........))).))))))))))).))))))).))))).).).))))....... (-35.20)