mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAACACTGTCTGGTAACGATGT ATCTTACTAGACAGTGCTGGA GGTCCTCTGTGGGCATCTTACTAGACAGTGCTGGATTTCTTGGATCTATTCTAACACTGTCTGGTAACGATGTTTAAAGGGTGAACC 1 1 3' arm Gallus_gallus mirbase mir-8 4e-37 tgu-mir-200a 1e-30 -37.34 ((((((((.(((((((((((((((((((((.((((..............)))).))))))))))))).)))))))).)))).).))) (-37.34)