mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGTGCTTGATCTAACCATGT ATGGTTCTGTCAAGCACCATG TGATAATGTAGCGAGATTTTCTGTTGTGCTTGATCTAACCATGTGGTTGTGAGGTATGAGTAAAACATGGTTCTGTCAAGCACCATGGAACGTCACGCAGCTTTCTACA 3 0 5' arm Gallus_gallus mirbase mir-218 3e-48 mdo-mir-218 1e-52 -38.05 .((....((.(((.(((.((((((.(((((((((..((((((((....................))))))))..))))))))).)))))).))).))).))..)).... (-38.05)