mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGTGCTTGATCTAACCATGT ATGGTTCTGTCAAGCACCATG GGGGTTTTCCTTTGTGCTTGATCTAACCATGTGGTAGAACAATACAAATTGAACATGGTTCTGTCAAGCACCATGGAAGGCTGCATACTCCCTGC 4 0 5' arm Gallus_gallus mirbase mir-218 8e-45 tgu-mir-218-2 5e-46 -37.4 (.((((((((...(((((((((..((((((((.(((......))).......))))))))..)))))))))...)))))))).)........... (-37.40)