mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATTGTCCAAACGCAATTCT AATTGTGTCTGGACATCTGT CTCTGCTCCTGATTGTCCAAACGCAATTCTTGTGCGCTGGAGCCGTACGAACCAAGAATTGTGTCTGGACATCTGTAGCAGAGAT 2 1 5' arm Gallus_gallus mirbase mir-219 7e-36 gga-mir-2964 4e-43 -39.7 (((((((.(.(((.(((((.(((((((((((((((((....).))))).....))))))))))).)))))))).).))))))).. (-39.70)