mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAATGCCCCTAAAAATCCTTAT GAGGGACTTTTGGGGGCAGATGT CGCAGGGAAAATGAGGGACTTTTGGGGGCAGATGTGTTTCCATTACACTATCATAATGCCCCTAAAAATCCTTATTGCTCTTGCA 4 1 3' arm Gallus_gallus mirbase mir-365 7e-42 mdo-mir-365 4e-43 -37.9 .((((((..((((((((..((((((((((((((((((.......)))).)))....))))))))))).))))))))..)))))). (-37.90)