mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAATGCCCCTAAAAATCCTTAT GAGGGACTTTCAGGGGCAGCTGT GGCAGCAAGAAAAATGAGGGACTTTCAGGGGCAGCTGTGTTTTACTAACCCAGTCATAATGCCCCTAAAAATCCTTATTGTTCTTGCAATGGTCAA 5 1 3' arm Gallus_gallus mirbase mir-365 2e-39 tgu-mir-365-2 7e-45 -38.5 (((.(((((((.((((((((..(((.(((((((((((.(((.....))).)))).....))))))))))..)))))))).)))))))....))).. (-38.50)