mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCTGTCGGTGGGTTTGTTCT TGCAGGTCCCCAAGGGCAGCCGG GGATGGCTGTGTTTGCTTTGAAGCTCTGCTGTCGGTGGGTTTGTTCTGCAGGTCCCCAAGGGCAGCCGGGCTCCGTGTGCTGCTCAGCTGACC 7 2 5' arm Gallus_gallus mirbase 100 100 -39.5 ((.((((((.((..((..((.(((((.((((((..((((((((.....))))..))))..)))))).))))).))...)).)).)))))).)) (-39.50)