mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGCTGGTGGAGGGAGCTGAG CAATCACTATTACCAGCAGT GATGTCAGTAGAAAAAATTGAGGCTTGCTGGTGGAGGGAGCTGAGCATGGCTCAATCACTATTACCAGCAGTAGAAGTTTTGATTTAAGGGATC 2 3 5' arm Gallus_gallus mirbase 100 gga-mir-1654-2 2e-48 -29.2 (((.((..((((.((((((...(((.((((((((.((((..(((((...))))).)).)).)))))))))))...))))))..)))).)).))) (-29.20)