mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATATGTGTATTGTTGGTGTGTG TACATCAACACATACTTATATTTG GAGAAGTATATGTGTATACATCAACACATACTTATATTTGTATATGGATTTACATATATGTGTATTGTTGGTGTGTGATACGATATTCCATATC 3 1 3' arm Gallus_gallus mirbase 100 100 -27.8 ..(.(((((.((((((((((((((((.((((.(((((.((((........)))).))))).))))))))))))))).)))))))))).)..... (-27.80)