mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTATTGGAACACTACAGCTC GTTGTAGTCTTTCAAACAGA GGAATATTCTGGGAGTTGTAGTCTTTCAAACAGAGCTTTGCAAGGACATACCTGTATTGGAACACTACAGCTCCCTGAACTTCC 1 1 3' arm Gallus_gallus mirbase 100 gga-mir-1805 2e-42 -33.1 ((((..(((.((((((((((((.((((((((((.(...((......))..))))).)))))).)))))))))))).))).)))) (-33.10)