mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CACAAGAATTGCGTTTGGACAA TCCAGACACAATTCTTGGTTC AATCTCTGCTACAGATGTCCAGACACAATTCTTGGTTCGTACGGCTCCAGCGCACAAGAATTGCGTTTGGACAATCAGGAGCAGAGATT 4 0 3' arm Gallus_gallus mirbase mir-219 7e-36 gga-mir-219 4e-43 -43.3 ((((((((((...(((((((((((.(((((((((...(((..(....).)))..))))))))).)))))))).)))...)))))))))) (-43.30)