mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGGCAGACTGTGACTTGTTGT AACAAAATCACTAGTCTTCCAGA GGCCGTGCGCCCTAAGGCAGACTGTGACTTGTTGTGGTGGGATGAGCCATACAACAACAAAATCACTAGTCTTCCAGAGGGCACCGCGGCC 3 2 5' arm Gallus_gallus mirbase mir-7 2e-45 gga-mir-7-2 1e-46 -48.7 (((((((.(((((..((.(((((((((.(((((((.((((......))))...)))))))..)))).))))).))..)))))..))))))) (-48.70)