mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGGTAGTAGGTTGTATAGTT CTATACAGTCTATTGCCTTCCT TCTGTGGAGGTGAGGTAGTAGGTTGTATAGTTTGGTGGGAGGGATTTGATCCCATTTCAGGTGATAACTATACAGTCTATTGCCTTCCTTAA 3 0 5' arm Taeniopygia_guttata mirbase let-7 1e-43 gga-let-7j 1e-34 -39.1 ......((((.((((((((((..(((((((((...((..((((((...))))).)..))......)))))))))..)))))))))))))).. (-39.10)