mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGAGGTAGTAGGTTGCATAGTT CTATACAACCTGCTGCCTTTCT GCTCCTAGGAAGAGGTAGTAGGTTGCATAGTTTTAGGGCAGGGATTTTGCTCAGAAGGAGGTAACTATACAACCTGCTGCCTTTCTTAGGGC 2 0 5' arm Taeniopygia_guttata mirbase let-7 5e-37 gga-let-7d 2e-42 -43.11 ((.(((((((.((((((((((((((.((((((((.((((((.....)))))).)).......)))))).))))))))))))))))))))))) (-43.11)