mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAATGTAAAGAAGTATGTAT ACATACTTCTTTATGTACCCATA CACATACTTCTTTATGTACCCATATGAACATACAATGCTATGGAATGTAAAGAAGTATGTATTTTTGGCAGG 3 1 3' arm Taeniopygia_guttata mirbase mir-1 5e-30 gga-mir-1a-2 2e-35 -20.74 .((((((((((((((((..(((((..............))))).))))))))))))))))............ (-20.74)