mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAGGTGCATCTAGTGCAGTTA TGGCGATTCCGTGGTGGTGGCAGGGCACGGACAAAACCAGGATTGTTGTGCTGCCTTAGGCCAC ACTTCTGGCATTACTGTGGCGATTCCGTGGTGGTGGCAGGGCACGGACAAAACCAGGATTGTTGTGCTGCCTTAGGCCACGCTGCAAAAGGTCCTTGTGTTAAGGTGCATCTAGTGCAGTTAGTGATGTAGC 3 67 3' arm Taeniopygia_guttata mirbase 100 gga-mir-18b 0.000000000000002 -42.9 .......(((((((((.........((((((...(((((.(((...((((........))))))).)))))....))))))(((((..(((((((((...)))))...))))..))))).)))))))))... (-42.90)