mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCACAGTGGCTAAGTTCTGC AGAGCTTAGCTGATTGGTGAACA ATCTCTCTGGCGAGGTGCAGAGCTTAGCTGATTGGTGAACAGTGATTGTTTTCCTCTTTGTTCACAGTGGCTAAGTTCTGCACCTGAAGAG 2 2 3' arm Taeniopygia_guttata mirbase mir-27 2e-30 gga-mir-27b 1e-40 -44.4 ....((((..(.((((((((((((((((((....((((((((.((.........)).))))))))..))))))))))))))))))).)))) (-44.40)