mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGGCAAGATGTTGGCATAGCTG TGCTATGCCAACATATTGTCATC TTCCTTTATGCAGAGCTGGAGAGGAGGCAAGATGTTGGCATAGCTGTTGATCTAAAAACCTGCTATGCCAACATATTGTCATCTTTCCTGTCTGTTTGCGGCAGAGGGA 3 0 5' arm Taeniopygia_guttata mirbase mir-31 5e-31 gga-mir-31 5e-37 -52.4 (((((((.((((((((.((((((..(((((.(((((((((((((.(((........)))..))))))))))))).)))))..)))))).))...))))))..))))))) (-52.40)