mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAGGCACGCGGTGAATGCCA GTGTTCACAGCGGACCTTGAT AGAGAGAGAGAGCGAGACAGAGCACTCTAAGGCTCTGACTCTCCGTGTTCACAGCGGACCTTGATTTAATGTCATACAATTAAGGCACGCGGTGAATGCCAAGAGCGGATC 5 0 3' arm Taeniopygia_guttata mirbase mir-124 9e-33 gga-mir-124a 8e-39 -38.8 ......((((.((........)).)))).....((((.((((..((((((((.(((..((((((((...........))))))))..))).))))))))..)))))))).. (-38.80)