mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCACAGTGAACCGGTCTCTTT GGGGGCCGTTACACTGTAAGAGA GTGGCCGTCGGACCCCGTGCGGCTGGAAGGGGGGCCGTTACACTGTAAGAGAGTGAGTAGCAGGTCTCACAGTGAACCGGTCTCTTTTCCTGCTGTGTCACGCCACTCCG 3 2 3' arm Taeniopygia_guttata mirbase mir-128 1e-37 gga-mir-128-2 8e-39 -49.8 (((((.((..(((.....(((((.(((((((((((((...((((((..((((.(........).))))))))))...))))))))))))).))))))))))))))).... (-49.80)