mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGGCTTTTTATTCCTATGTGA ATGTAGGGATGGAAGCCATGAA TCTAGTGTTTTATGGCTTTTTATTCCTATGTGATAGTAATAAAGTCTCATGTAGGGATGGAAGCCATGAAATA 0 1 5' arm Taeniopygia_guttata mirbase mir-135 8e-35 gga-mir-135a-2 5e-36 -29.3 .....(((((((((((((((.((((((((((((.(.(.....).).))))))))))))))))))))))))))) (-29.30)