mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGGCTTTTTATTCCTATGTGA ATGTAGGGCGAAAAGCCATGGG CCTCTGCTGTGGTTTATGGCTTTTTATTCCTATGTGATTGCTTTCCCGAACTCATGTAGGGCGAAAAGCCATGGGCTACACAGAGG 1 1 5' arm Taeniopygia_guttata mirbase mir-135 4e-31 gga-mir-135a-3 2e-32 -44.2 ((((((.((((((((((((((((((..((((((((((...(......)...)))))))))).)))))))))))))))))))))))) (-44.20)