mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGGCTTTTTATTCCTATGTGA ATATAGGGATTGAAGCCGTGCA TGCCGTCTTGTATGGCTTTTTATTCCTATGTGATTATACATCCCACTTCATATAGGGATTGAAGCCGTGCAGT 1 1 5' arm Taeniopygia_guttata mirbase mir-135 8e-35 gga-mir-135a-1 1e-27 -30.34 .......((((((((((((..((((((((((((..............)))))))))))).)))))))))))). (-30.34)