mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAC CCTGCCTTGCATCAACTGAAT CAACTTTTTTGCGGCCGCCTCTTATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGACCTCATTCGCCGGCGCCGGGAATAATGCCGGACGAACGACGGCGGTGTTAATTCTACTAAAGCTGTCACCGACGGATAGATGTTTGATTAGCGGCGAAATTTGGGTCCTGCCTTGCATCAACTGAATTGGAGACCGCTGTGAAATGAAG ATCTCTGCCCTTTGTTCAGTTCAACTTTTTTGCGGCCGCCTCTTATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGACCTCATTCGCCGGCGCCGGGAATAATGCCGGACGAACGACGGCGGTGTTAATTCTACTAAAGCTGTCACCGACGGATAGATGTTTGATTAGCGGCGAAATTTGGGTCCTGCCTTGCATCAACTGAATTGGAGACCGCTGTGAAATGAAGATTTTGGATTGATTTAATCTAACTCAGATTCGGTTTAGATCGATCTAGTATTGGCGATTTGCTTTGCCTCAGCAATCTTCATGAAACTAATGGCTAAACGATGTTTTGGATACTCTAATTGGTCATAGAGTTTTCTTGGACTCTCCAAAATGCCGATGGGTGCGTGTCTTCCAAAGGCCTTGTATAGACATTTTTATACTCTAATTGGTCATAGAGTTCACTGACTAGAAAAGCTACGATGCTGTGAAACTGTGATGGAACTTTGGATAAAGATTATTGTTACCCTCTGCTATGTATGTGGATGTCAATCTCCTCACATACTCTGTCTTCTATGAATTTACCAGTCTGGGATCTAATCTGATTGCATTCCTTCCTAGGTAATGACAACTTTTTACATTGCAAATAAGCAGCTTATTACAGCATCTCTACTAGACTTTTTTCTTCGCCCACGAGTTTATCCACTGTGT 2 0 5' arm Solanum_lycopersicum mirnest MIR168 0.0000002 tcc-MIR168 0.0000002 -68.1 ......(((((((((...((((.(((((.((((((((((.((((((((..(((((((.((((((........)))).))...((((((..((.((....)).))..))))))...(((((((....))))).))..)))))))....)))))))).)))))))))).))))).))))...)))))))))..... (-68.1)