mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTACAGTGCATGTGTCTCCAGT TGGAGATGCGGCCCTGTTGGAAT GGCCTGGCTGTATTCTACAGTGCATGTGTCTCCAGTGTGAGTAAGTGACTGGAGATGCGGCCCTGTTGGAATAACATCCAGTGCC 1 2 5' arm Taeniopygia_guttata mirbase mir-139 1e-31 mdo-mir-139 2e-23 -41.4 (((((((.((((((((((((.((.((((((((((((...........)))))))))))))).))).)))))).))).)))).))) (-41.40)