mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGTGGTTTTACCCTATGGTAG ACCACAGGGTAGAACCACGGAC CGTGTCCTGCCAGTGGTTTTACCCTATGGTAGGTTACGTCATGCTGTTCTACCACAGGGTAGAACCACGGAC 3 0 5' arm Taeniopygia_guttata mirbase mir-140 3e-34 gga-mir-140 2e-35 -34.2 ...((((.....(((((((((((((.(((((((..(((......)))))))))).))))))))))))))))) (-34.20)