mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGTCCATGGTATTCAGTTCTCT AGAACTGAATTCCATGGACTGG TGTGACGAATGTTGGCAGTTCCCAGCTCTGAGAACTGAATTCCATGGACTGGTTCCAGTTCCATGTGTTCAGTCCATGGTATTCAGTTCTCTAGCTTGGCTGCATCAAACTTCACA 2 0 3' arm Taeniopygia_guttata mirbase mir-146 1e-41 gga-mir-146c-1 6e-52 -54.8 .((((.(..((...((((..((.((((..(((((((((((.(((((((((((...((......))...))))))))))).))))))))))).)))).))))))..))..).)))). (-54.80)