mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAATGCCCCTAAAAATCCTTAT AGGGACTTTTGGGGGCAGATGT AGGGACTTTTGGGGGCAGATGTGTTTCCATTACACTATCATAATGCCCCTAAAAATCCTTATTGCTCTTGCA 6 0 3' arm Taeniopygia_guttata mirbase mir-365 3e-34 gga-mir-365-1 2e-35 -28.8 (((((.((((((((((((((((((.......)))).)))....))))))))))).)))))..(((....))) (-28.80)