mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAATGCCCCTAAAAATCCTTAT GAGGGACTTTCAGGGGCAGCTGT TGCCCTCCTGGGGACCGACTGAGCGGCAGCAAGAAAAATGAGGGACTTTCAGGGGCAGCTGTGTTTTACTAACCCAGTCATAATGCCCCTAAAAATCCTTATTGTTCTTGCA 5 1 3' arm Taeniopygia_guttata mirbase mir-365 9e-36 gga-mir-365-2 9e-45 -45.3 .(((((((.(....).)...))).))).(((((((.((((((((..(((.(((((((((((.(((.....))).)))).....))))))))))..)))))))).))))))). (-45.30)