mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGCAAGTTGTCCCTGGCTATA CAGCCAGGGATGACTTGCCGA GTATAATTTCTGTGTGGAAGGAAATTTACATGAAGAAATGGAGAATGGTTTGCAGCCAGGGATGACTTGCCGAGGTTCTCTTACAAATTATTCTATTAAGGATTTTGCGTCGGCAAGTTGTCCCTGGCTATATTTCGCTCTCTTCTTCTCATGCAAACTTCTTCACACCTATTTTTATTTT ATGAAAGTTATTTATTCAAAGAAAAGAAAATATTTGTATAATTTCTGTGTGGAAGGAAATTTACATGAAGAAATGGAGAATGGTTTGCAGCCAGGGATGACTTGCCGAGGTTCTCTTACAAATTATTCTATTAAGGATTTTGCGTCGGCAAGTTGTCCCTGGCTATATTTCGCTCTCTTCTTCTCATGCAAACTTCTTCACACCTATTTTTATTTTATTTATAG 1 0 3' arm Solanum_melongena mirnest 100 ath-MIR169b 0.0000000006 -64.9 ...........((((((..((((.(((.(((((.(((..(((((.(((..((.((((((((((((((((((((.((..(((((.............))))).....)).)))))))))))))))))))).))..))).)))))..)))))))).))).))))))))))............. (-64.9)